Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ube2d1P61080 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms