Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sem1P60897 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sem1P60897 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sem1P60897 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sem1P60897 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sem1P60897 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sem1P60897 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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