Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms