Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ActbP60710 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ActbP60710 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ActbP60710 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ActbP60710 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ActbP60710 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ActbP60710 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ActbP60710 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms