Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms