Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms