Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms