Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scarf2P59222 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms