Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrh3P58406 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms