Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf16P58334 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms