Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpdl3bP58242 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpdl3bP58242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms