Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms