Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms