Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AgrpP56473 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AgrpP56473 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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