Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab8aP55258 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms