Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pex2P55098 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pex2P55098 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms