Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acod1P54987 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acod1P54987 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Acod1P54987 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms