Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms