Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Faf1P54731 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms