Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23aP54726 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23aP54726 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms