Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RabggtbP53612 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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