Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efna1P52793 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efna1P52793 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efna1P52793 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms