Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms