Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp10P52479 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms