Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApodP51910 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApodP51910 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApodP51910 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApodP51910 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ApodP51910 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms