Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr4P51680 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms