Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms