Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms