Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms