Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epb42P49222 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms