Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms