Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rfx1P48377 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx1P48377 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms