Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VdrP48281 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VdrP48281 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VdrP48281 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms