Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms