Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gli1P47806 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gli1P47806 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms