Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms