Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgavP43406 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgavP43406 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms