Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NodalP43021 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NodalP43021 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NodalP43021 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NodalP43021 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NodalP43021 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NodalP43021 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NodalP43021 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NodalP43021 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NodalP43021 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NodalP43021 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms