Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lig1P37913 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lig1P37913 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig1P37913 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms