Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpargP37238 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpargP37238 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpargP37238 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms