Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms