Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms