Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc1P34928 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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