Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms