Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd1P30999 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms