Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms