Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxraP28700 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxraP28700 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxraP28700 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxraP28700 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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