Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms