Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb3P28231 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms