Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms